Родился в 1978 году в Нанси.
Обучался органу у Кристофа Мантуа, историческому исполнительству у Мартина Гестера и клавесину у Алине Зильберайх в Национальной консерватории в Страсбурге, где был удостоен первого органного приза.
После окончания консерватории в Страсбурге обучался в Национальной Парижской консерватории у Мишеля Бувара и Оливье Латри, где также получил несколько первых органных призов.
В 2004 году Йоанн Вексо был удостоен посла органиста хорового органа собора
Играет множество концертов по всему миру — в Европе, Америке, Азии и Африке. Записал множество